重庆国家生物产业基地公共实验中心自建设以来，投入大量资金，购置一系列的新设备，在原有设备基础上形成完善的荧光显微镜配套体系、分子生物学功能测试体系、生物材料的体内外力学评价体系、环境理化及生态毒理学监测系统、各类血液及生物相容性评价体系等。中心现有仪器设备187台套，其中国拨资金700余万元购置仪器设备60台套，自筹资金2100余万元购置仪器设备127台套。